學校堅持以學科建設為龍頭,不斷整合學科資源,精簡學科方向,大力推進壹流應用學科建設。目前,機械工程、電氣工程、土木工程、工商管理等4個江蘇省重點學科獲批江蘇省高校文創協同創新中心牽頭建設單位;江蘇省高校重點(建設)實驗室2個,常州市重點實驗室9個,省工程研究中心4個,有電子廢物回收利用、危險化學品廢物和工業固體廢物協同處置、報廢汽車綠色精細拆解利用聯合創新實驗室。
共建成省部級重點實驗室、公共服務平臺、工程技術研究中心、工程研究中心等30個科研平臺。擁有江蘇省高校優秀的科技創新團隊,如信息感知與無人機應用研究、智能網聯汽車信息安全等,江蘇省博士後創新實踐基地,集R&D、產學、實踐於壹體的常州科技企業孵化器——常州工學院大學科技園,數控技術應用與裝備、軟件、建築工程技術等10產學研壹體化中心。