公安機關已經凍結犯罪嫌疑人存款的，不能直接追回，只能在證明其犯罪事實後對其財產進行執行。《刑事訴訟法》規定，人民檢察院、公安機關根據偵查犯罪的需要，可以依照規定查詢、凍結犯罪嫌疑人的存款、匯款、債券、股票、基金份額等財產。有關單位和個人應當予以配合。
法律客觀性:
《中華人民共和國刑事訴訟法》第壹百四十四條人民檢察院、公安機關根據偵查犯罪的需要，可以依照規定查詢、凍結犯罪嫌疑人的存款、匯款、債券、股票、基金份額等財產。有關單位和個人應當予以配合。犯罪嫌疑人的存款、匯款、債券、股票、基金份額等財產已經被凍結的，不得再次凍結。