建立健全新農保基金財務會計制度。按國家的相關規定，新農保基金納入社會保障基金財政專戶，實行收支兩條線管理，單獨記賬、核算，實現保值增值。試點階段，新農保基金以縣級為統籌單位，實行預決算制度。縣級人力資源社會保障部門要會同同級財政部門編制新農保基金年度收支預算，報縣級人民政府批準後執行，並將年度決算表報上級主管部門審核。隨著試點擴大和推開，逐步提高管理層次。