民國以後，先農壇逐漸衰落，許多建築被拆除。1916先農壇被辟為南園。1936年，在原址東南角修建北平宮x體育場，後改名先農壇體育場。目前，先農壇建築群有北京古建築博物館。
65438年6月至0949年7月，華北育才小學(後稱北京育才學校)遷至北京，落戶先農壇。先農壇太歲殿被育才學校占用，陳設廳被中國醫學科學院醫學研究所占用。
1979被列為北京市市級重點文物保護單位。2001年被列為全國重點文物保護單位。
1997，育才學校圖書館從所有服務大廳遷出。
1998和2000年，世界古跡基金會為先農壇的修繕提供了資金。1998和1999，美國運通基金會提供資金，用於北京先農壇的賈府會館和廚師的裝修。
2000年劃歸文物部門管理，現在正在進行大規模的搶救性修繕。