政府性基金預算的管理原則是：“以收定支、專款專用、結余結轉使用”。基金支出根據基金收入情況安排，自求平衡，不編制赤字預算。當年基金預算收入不足的，可使用以前年度結余資金安排支出；當年基金預算收入超出預算支出的，結余資金結轉下年繼續安排使用。各項基金按規定用途安排，不調劑使用。