事業單位應設置“事業基金”科目，核算事業基金的各項來源、運用和結存，並在該科目下設“壹般基金”和“投資基金”兩個明細科目。
事業基金的主要賬務處理如下：
（壹）年末，將“非財政補助結余分配”科目余額轉入事業基金，借記或貸記“非財政補助結余分配”科目，貸記或借記本科目。
（二）年末，將留歸本單位使用的非財政補助專項（項目已完成）剩余資金轉入事業基金，借記“非財政補助結轉—××項目”科目，貸記本科目。
（三）以貨幣資金取得長期股權投資、長期債券投資，按照實際支付的全部價款（包括購買價款以及稅金、手續費等相關稅費）作為投資成本，借記“長期投資”科目，貸記“銀行存款”等科目；同時，按照投資成本金額，借記本科目，貸記“非流動資產基金—長期投資”科目。
（四）對外轉讓或到期收回長期債券投資本息，按照實際收到的金額，借記“銀行存款”等科目，按照收回長期投資的成本，貸記“長期投資”科目，按照其差額，貸記或借記“其他收入—投資收益”科目；同時，按照收回長期投資對應的非流動資產基金，借記“非流動資產基金—長期投資”科目，貸記本科目。