1，定點醫療機構每月10前，將上月出院的費用結算單、住院結算單及相關資料報送醫療保險經辦機構，醫療保險經辦機構審核後，作為每月預撥和年終決算的依據；醫保經辦機構預撥上月特殊疾病住院和門診統籌費用。
2.被鑒定患有特殊疾病的參保人員，應當到勞動保障部門指定的定點醫療機構就醫、購藥，所發生的醫療費用直接記賬、即時結算。
3.急診結算程序:被保險人因急診搶救到市內非定點醫療機構和異地醫療機構發生的醫療費用，先由個人或單位先行墊付。急診搶救結束後，醫療保險經辦機構憑急診病歷、檢查、化驗單、發票、醫療費用明細清單按規定辦理報銷手續。
擴展數據:
以下不納入農村合作醫療保險報銷範圍:
1.自費就醫(無定點就醫醫院或無轉診單)、自費購藥、公費醫療規定不能報銷的藥品和不符合計劃生育要求的醫療費用；
2、門診治療費、出診費、住院費、餐費、陪護費、營養費、輸血費(家庭儲血者除外，按有關規定報銷)、取暖降溫費、救護車費、優撫費等費用；
3.車禍、打架、自殺、酗酒、工傷事故和醫療事故的醫療費用；
4.骨科、整容、種植牙、假肢、器官移植、點名手術費、咨詢費等。；
5、報銷範圍內，超出限額。
很多農民在購買了新農合之後，都買了壹些商業醫療保險。買商業醫療保險的話，要先報銷新農合的費用，剩下的費用再找保險公司報銷。
百度百科-醫保報銷範圍