第壹，基金管理人和基金托管人之間的相互監督和核查。例如，基金托管人應依據法律法規和基金合同的約定，對基金投資對象、投資範圍、投融資比例、投資禁止行為、基金參與銀行間市場的信用風險控制等進行監督；基金管理人應對基金托管人履行賬戶開設、凈值復核、清算交收等托管職責情況等進行核查。
第二，協議當事人權責約定中事關持有人權益的重要事項。例如，當事人在凈值計算和復核中重要環節的權責，包括管理人與托管人依法自行商定估值方法的情形和程序、管理人或托管人發現估值未能維護持有人權益時的處理、估值錯誤時的處理及責任認定等。
基金托管協議的主要內容：(1)托管協議當事人；(2)托管協議訂立的依據、目的和原則；(3)基金托管人與基金管理人之間的業務監督、核查；(4)基金資產保管；(5)投資指令的發送、確認及執行；(6)交易安排；(7)資產凈值計算和會計核算；(8)基金收益分配；(9)基金持有人名冊的登記與保管；(10)信息披露；(11)基金有關文件檔案的保存；(12)基金托管人的報告；(13)基金托管人和基金管理人的更換；(14)基金管理人的報酬和基金托管人的托管費；(15)禁止行為；(16)違約責任；(17)爭議的處理；(18)托管協議的效力；(19)托管協議的修改和終止。