1、註冊機構不同：見義勇為基金會是在民政部門註冊的公募基金會，而見義勇為協會則是在民政部門註冊的社會團體。
2、組織形式不同：見義勇為基金會是以公募基金會的形式進行運作，主要通過募捐等方式籌集資金，為見義勇為者及其家庭提供各種幫助。見義勇為協會則是以社會團體的形式進行運作，主要通過會員的自願捐款和其他資金渠道，開展與見義勇為相關的公益活動。
3、活動領域不同：見義勇為基金會的活動領域主要集中在對見義勇為者及其家庭的資助和援助上，包括醫療救助、生活救助、子女教育等方面。見義勇為協會則更多地關註見義勇為的宣傳和推廣、社會道德建設以及對見義勇為者的表彰和獎勵等方面。