按照政府會計制度的年終結轉流程，當年“非財政撥款結余分配”有結余的，按照有關規定應當提取專項資金的，轉入“專項結余”，結余轉入“非財政撥款結余”。
專用基金結余是各級總預算會計管理的專用基金收入與支出年終結余的差額，是財政三大結余之壹，屬於各級財政部門的凈資產。