教育局內設辦公室負責局機關重要黨務、政務和事務的綜合協調；負責起草教育局工作計劃、總結、綜合相關書面材料；負責黨委、常務會議、局長辦公會議、局級重要會議的組織安排和會議議定事項的督辦；負責上級部門和局領導交辦的重要事項的督辦；
組織協調全國目標辦下達的各類目標的監督、匯總和上報工作；負責文秘、機要、檔案、信訪、保密、安全、信息和後勤管理工作；負責統籌綜合管理、對外宣傳和政務公開工作；負責組織編寫教育年鑒和教育誌；負責NPC提案和CPPCC提案的辦理工作；負責科教興國。
人事部門負責全國教育系統的人事管理、教師輪崗、表彰、獎懲、人事管理制度改革；負責教師資格認證；負責局機關和直屬單位處級幹部的任免和備案；負責民族中小學編制的調整和管理。
人事部門還負責師範院校畢業生的就業指導；直接管理教育局及直屬中小學教職工的招聘和流動手續；負責教師獎勵基金會的管理工作；負責教育系統的知識分子工作和專家管理。
財務部的職責:
會同有關部門制定教育經費管理和籌措的相關政策法規；統計和監測國家教育經費和計劃的執行情況；管理和監督國家、省和國家撥付的各類專項資金以及教育貸款、教育集資、捐贈、教師獎勵基金等項目的使用；管理使用國家財政部門下達的專項資金；教育經費的統籌管理。