1、預申請。申請單位請於7月5日-7月29日16時登陸科學基金網絡信息系統，點擊新單位註冊申請系統進行單位註冊預申請，申請單位在提交預申請3個工作日後進入申請系統查看受理狀態，預申請通過並獲得受理號後方可填報依托單位註冊申請書；
2、申請書的填寫：申請單位應當進入申請系統在線填寫申請書，提交電子版後打印紙質版申請書1份，申請書紙質原件應與電子版內容壹致。申請單位應當對所提交申請材料的真實性和有效性負責，申請材料內容不得包含涉密和敏感信息；
3、申請材料的報送。申請單位應當於8月5日16時前將完整的申請材料（采用單面打印，不加封皮的普通裝訂），送交或郵寄至材料接收組。采用郵寄方式的單位，請在截止日期前以速遞方式郵寄，並在信封左下角標註“單位註冊申請材料”；
4、申請材料的修改與補齊；
5、申請單位的審核與審批。自然科學基金委對申請單位的基本條件、管理能力以及基礎研究能力進行審核，並組織專家進行評審，於11月底前將審批決定通知申請單位。申請單位也可登陸科學基金網絡信息系統，查詢審批結果。
法律依據：《國家自然科學基金委員會信息公開管理辦法》第五條
自然科學基金委應當及時、準確地公開信息。發現影響或者可能影響科學基金管理秩序的虛假或者不完整信息的，應當發布準確的信息予以澄清。