債券ETF壹般主要采用代表性分層抽樣復制策略，根據標的債券指數中成份券的規模、流動性等指標，抽樣選取其中規模較大、流動性較好的債券。對於那些流動性差的債券，債券ETF壹般是不會抽樣的。
債券ETF作為存續期限不定的開放式基金，其資產組合始終處於動態調整的過程中，持有債券ETF相當於持有永不到期的債券。債券ETF雖好，但不代表債券ETF穩賺不賠。
債券ETF的成份券可能受各種因素的影響而波動，從而引起債券ETF資產凈值的波動，產生潛在的投資風險。盡管債券ETF 存在壹定的套利機制使其交易價格與凈值趨於壹致，但基金交易價格會受市場供求等因素影響，可能出現短期偏離基金份額凈值的情形。
申購時，如果投資人未能提供符合要求的申購對價，申購申請可能失敗；贖回時，如果投資人持有的符合要求的基金份額不足或未能按要求準備足額的現金，或基金投資組合內不具備足額符合要求的贖回對價，贖回申請可能失敗。
由於ETF存在客觀風險，所以投資者在投資的時候充分考慮。債券的收益也是比較高的，由於流動性差的債券存在，拉低了總體收益。但是債券ETF主要選擇規模較大、流動性較好的債券，所以收益壹般高於直接投資債券。