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方正曾參與重要科研。

l獨立負責863重點項目“活體小動物光學分子成像裝置”微型CT部分的研制。

l參與863計劃生物信息技術主題項目“數字人虛擬人體”中的頭部血管圖像分割。

l參與實驗室“數字鼠標”科研項目的數據收集。

l參與水稻形態參數自動提取項目的數據采集和後期圖像處理。

l負責開發三套不同用途的微型CT系統。用於體外小動物成像的微CT系統,用於水稻分蘗成像的微CT系統,用於體內小動物成像的微CT系統。

l工業和信息化部基礎科研項目“基於光譜指紋的多光譜圖像新方法及關鍵技術”。

l國家863計劃“光電成像特征提取與識別技術”,第四人完成。

l參與國家自然科學基金重點項目“高速平臺上運動目標多模式檢測與識別的理論、方法及關鍵技術”。

l中國博士後科學基金“X射線掠入射顯微CT成像新方法及關鍵技術研究”,項目負責人。

l參與國家自然科學基金青年科學基金項目“骨組織靶向沈默PPARγ基因治療糖皮質激素性骨質疏松癥的實驗研究”,第三參與人。

l“三維形貌快速測量新方法及關鍵技術”,航天支撐技術基金項目負責人。