醫保門診統籌按人頭付費的意思是醫保中心與醫院結算門診費用是按人次乘以核定的次均門診費用。
財政部、人力資源社會保障部和國家衛生計生委聯合發布《關於加強基本醫療保險基金預算管理發揮醫療保險基金控費作用的意見》，其中明確提出實施基本醫療保險支付方式改革，全面實施以總額預算為基礎，門診按人頭付費，住院按病種、按疾病診斷相關分組（DRGs）、按床日付費等多種方式相結合，適應不同人群、不同疾病及醫療服務特點的復合支付方式，逐步減少按項目付費，將支付方式改革覆蓋所有醫療機構和醫療服務。
門診統籌按人頭付費結算按照月度預付和年終清算相結合的方式進行。
結算公式：
月度門診統籌基金應預付額=（簽約醫療機構年度門診統籌基金人均定額/12）×當月10日簽約人數。
月度門診統籌基金實際預付額=月度門診統籌基金應預付額×95%。其中扣除5%作為考核金，在年度考核時根據考核成績兌付。
年終清算總額=簽約醫療機構年度應預付門診統籌基金總額-簽約醫療機構年度實際醫療費用墊付額。其中，年度應預付基金總額等於各月度門診統籌基金應預付額之和。
年終清算時，門診統籌簽約醫療機構定額使用率不超過70%的，按項目結算方式據實結算，結余資金全部作為下年度預撥定額資金。