1、將自然科學基金與往年本子重復率相似度超過50%的申請項目轉科學部，作為項目評審參考。監督委員會對部門高相似申請進行了調查，調查後會進行相應處理、通報批評。
2、對自然科學基金與往年本子重復率相似度超過80%的66對申請項目開展調查，對其中嚴重的提交監督委員會全委會審議，處理相關當事人。