南京市紅十字會現有區 ( 縣 ) 級紅十字會 13 個、基層紅十字會組織 600 余個、會員 8 萬余人 ; 有 31 個公路沿線紅十字救護點和 27 個紅十字冠名單位 ; 有 434 個社區紅十字誌願工作者活動站；有紅十字新聞工作者誌願服務委員會、捐獻遺體誌願者之友、癌友康復協會、腎病患者之友、應急與災難應變誌願服務隊等誌願服務群體。為了擴大影響和增強救助能力，南京市紅十字會還成立了 “ 紅十字備災救助基金 ” 、 “ 紅十字旺旺博愛醫療基金 ” 和 “ 江蘇三胞集團紅十字事業生存與發展研究基金 ”，在全市賓館、機場、銀行、超市等地放置了 105 個募捐箱。
2004年8月5日，南京市紅十字會理順管理體制，機構規格為市副局級。由劉霞任黨組書記、專職副會長，調整後總編制數為行政編制 10 名、行政附屬編制 2 名。