住院甲類費用和乙類費用的區別通常是報銷比例不同。甲類藥物是臨床必備的藥物，藥物效果好，在醫保中屬於全部報銷的藥物；乙類藥物通常指的是臨床選擇使用效果好的藥物，在報銷的時候，乙類藥品需要病人自己付壹定的醫藥費，另壹部分由醫保基金支付。
法律客觀：《中華人民***和國城鎮職工基本醫療保險條例》 第四十壹條：省勞動保障行政部門根據國家有關規定，會同計劃、經貿、財政、衛生行政、藥品監督管理部門確定基本醫療保險藥品目錄。 省勞動保障行政部門根據國家有關規定，會同計劃、財政、衛生行政、藥品監督管理部門確定基本醫療保險診療項目目錄、醫療服務設施範圍和支付標準。 使用未納入基本醫療保險範圍的藥品、診療項目、醫療服務設施，其費用統籌基金不得支付。