究其原因，國家應對氣候變化戰略研究和國際合作中心首任主任、中國能源研究會可再生能源專業委員會主任委員李俊峰認為，補貼缺口變大的根本原因有二：
壹是征收不到位，導致入不敷出;二是征收額度沒有隨可再生能源規模的擴大而提高。
李俊峰指出，補貼來源是從可再生能源電價附加征收，每年應征收1000億元，但是征收比例僅75%左右，年度欠收200多億元，長此以往而造成了歷史欠賬，並多年累積、滾存而成為1000億元的缺口。在李俊峰看來，可再生能源附加的額度沒有按照可再生能源法的要求及時調整，補貼出現缺口成為必然。
因此有專家提出，在控制光伏發展速度的同時，財政應適當調增基金規模，適應發展需要。如果把全社會可再生能源電價附加全部收上來，所謂缺口就會大大減少。如果社會用電每度附加增加到3分錢，補貼將由此全部解決。