水利建設基金免征範圍:1，未達到增值稅起征點的生產經營單位和個體工商戶。2.國家規定免征增值稅的生產經營所得。3.湖南軍工企業銷售軍品收入(不含已核發工商營業執照的軍轉民企業)。4、國防工程、防洪工程(不含商業和服務設施建設)、孤兒院、敬老院建設用地。5.國家規定的其他免除。
水利建設基金的征收機關是財政部門，征收機關是:國稅部門、地稅部門、財政部駐廣西財政監察專員辦事處。繳納增值稅的企業、事業單位和個體工商戶，由國稅部門負責征收水利建設基金；繳納營業稅的非銀行金融機構、旅遊、交通運輸、建築安裝、文化體育、娛樂、餐飲等服務業的企業和個體工商戶。
繳納的水利建設基金，由地方稅務部門負責征收；對同時繳納增值稅和營業稅的企業，其繳納的水利建設基金由國稅部門和地稅部門分別按照繳納增值稅和營業稅的生產經營收入計算征收；對既繳納增值稅又繳納營業稅的個體工商戶，由國稅部門負責征收。