基金會首任理事長由前國家副主席王震同誌擔任。之後，理事長由前全國政協副主席錢正英同誌擔任。現任理事長為馬立同誌。基金會秘書處作為教育部直屬的司局級機構在理事會領導下負責基金會日常事務。
基金會自成立以來，受到歷屆黨和國家領導人的高度關註，***支出獎金和組織獎勵性活動經費近億元，獎勵了近5萬名全國優秀教師、全國優秀教育工作者和全國模範教師，現擁有基金50多億元。基金會通過獎勵教師，開展教師獎勵性質的活動，資助農村和邊遠貧困地區教師等，在全國產生了巨大的影響。特別是獎勵基金所特有的政府獎性質，規格高，影響大，為全社會所關註，其他獎勵形式難以替代。