1，普通人群門診胃腸鏡不能報銷；
2，以及住院期間如果有檢查指征，胃腸鏡檢查，這些可以醫保報銷。
3.對於胃癌和胃惡性淋巴瘤的人，如果是當地醫保範圍內的慢性病或重疾，即使在門診做胃鏡檢查，也可以享受醫保報銷，報銷比例和住院差不多。
醫療保險報銷流程
1.經辦人將報銷單據等材料提交社保經辦機構受理；
2.受理部門收到申請材料後進行審核、結算、支付；
3.社保經辦機構批準申請的，申請人在收到《社會醫療保險醫療費用報銷表》後予以報銷。
從上面可以看出，住院期間做胃鏡可以通過醫保報銷，而門診檢查是不能報銷的。當然這個需要根據當地的醫保政策來決定。
法律依據:
中華人民共和國社會保險法
第二
國家建立基本養老保險、基本醫療保險、工傷保險、失業保險和生育保險等社會保險制度，保障公民在年老、患病、工傷、失業和生育時依法從國家和社會獲得物質幫助的權利。
第二十六條
職工基本醫療保險、新型農村合作醫療和城鎮居民基本醫療保險按照國家規定執行。
第二十八條
符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準和急診搶救的醫療費用，按照國家規定由基本醫療保險基金支付。