2、首先確認自己是否夠條件申請相關的項目。國家自然科學基金資助的是自然科學基礎研究和部分應用研究，壹般是國內高校和科研單位中的研究人員。海外或者港澳臺地區申請是需國內依托單位的。
3、根據自己的職稱和年齡確定自己能夠申請的類型，如面上項目、青年科學基金等。
4、向自己所依托的單位科研管理部門申請國家自然科學基金項目申報系統的賬號和密碼，由相關管理人員在自然科學基金信息isis系統中添加本單位項目申請人。
5、登陸自然科學基金網絡信息ISIS系統確認自己申請的項目是否需要在線填寫還是離線填寫。
6、根據提示填寫相關的信息，提交項目申請書。確認提交後，打印項目申請書，本人及相關參與人員親筆簽字後，交單位蓋章，由單位統壹寄送國家基金委。