壹、中央液壓實驗室和中央液壓實驗室時期(1934 —1950年5月)
1934春:國家經委成立“中央水力實驗室籌備委員會”，積極負責中央水力實驗室的籌備工作。
1938 65438+10月:國家經委水利司劃歸經濟部管理，同年3月中央水力實驗室改為經濟部領導。
1941年9月:行政院水利委員會成立，包括中央水力實驗室在內的原經濟部管轄的水利機構全部改變隸屬關系。
1942 65438+10月:因業務範圍擴大，中央水力實驗室更名為“中央水力實驗室”。
1947 5月1:國民政府水利部成立，中央辦公廳由水利部領導。
1949年4月23日:南京解放。5月中旬，鐘石辦事處被南京軍區水務局接管，並積極準備恢復工作。
二、南京水利實驗辦時期(65438+5月0950-65438+2月0956)
1950年5月，“中央水利實驗所”更名為“中央人民政府水利部南京水利實驗所”。。
1953年3月華東軍政委員會水利部撤銷，南京水利實驗所由中央水利部直接領導。
(1)華東軍政委員會水利部代管期間(5月1950—3月1953)，研究室於3月1951撤銷，人員分別劃歸水工室和文獻室。同年，南京市水利實驗所支部成立，隸屬南京市壹級機關黨委領導。1952水文研究所並入中央水利部水文局，另成立材料試驗組。
(2)中央水利部直接領導時期(1953年3月-1956年2月)
5月1953、11日，經南京市政府黨委批準，組建南京市水利實驗分局。65438+2月，經上級批準成立黨組。同年，下屬水力儀器廠從南京水利實驗所分離出來，直接受中央水利部領導，更名為南京水力儀器廠。
1954年，經南京市委同意，恢復了黨支部的領導職能。在秘書室下面加壹個技術檔案室。
65438年至0956年，根據中央水利部指示，南京水利實驗所派出95人籌建北京水利科學研究所。
三。期南京水利科學研究所(1956 65438+2月-1984 65438+10月)
1956 65438+2月，南京水利實驗所更名為“南京水利科學研究所”。
(壹)文化大革命前夕更名為南京水利科學研究所(1956+65438-0966)
1956 65438+2月，將原水工、土工實驗室改為研究室，將原水工實驗室的潮波、泥沙組劃出，成立河港研究室。
1957年2月根據國務院科學計劃委員會關於國家水利科研機構合並的指示精神，南京水利科學研究院由水利部和交通部牽頭，港口工程與航道研究室，原為交通部水運科學研究院籌備處，並入該院。
1958水利部和電力工業部合並為水利電力部，南支由水利電力部和交通部領導。1958年2月，國務院農七企字23號文件同意成立錢塘江河口研究委員會，並明確將研究工作委托給南京水利學院。1958期間，交通部組織了“天津新港淤積研究領導小組”，負責該港淤積研究的技術領導。
(2)從文革開始到研究所改革的時期(1966-1984+0)
1966-1967，原來的組織特別是行政部門被打亂。
1968年，經江蘇省革命委員會批準，南京水利科學研究所革命委員會成立。
1973年8月，經江蘇省革命委員會批準，成立南京水利科學研究院委員會。
1979年2月水利電力部為水利部、電力工業部，南支為水利部、交通部領導。同年6月，水利部明確南京水利科學研究所為地市級單位。
1980，恢復兩級學術委員會活動。成立了研究所學位評定委員會和技術職稱評定委員會。
1982年2月，水利部、電力工業部合並為水利電力部，南京水利科學研究院恢復水利電力部、交通部領導。
四、南京水力研究所時期(1984 65438+2006年10月-65438+2月)。
1984 1月，經水利電力部批準，國家科委同意，更名為“水利電力部、交通部南京水利科學研究院”。1994年9月更名為“水利部、交通部、電力工業部南京水利科學研究院”。
1984 1月，醫院改革後，機構體系發生了很大變化，幹部也進行了全面調整，實行了黨委領導下的院長負責制。1984年8月，水利電力部、交通部批準我院為科研體制改革試點單位，實行院長負責制。
1985年3月，原屬於科研部的計算應用中心更名為計算中心，直屬院長領導。
1987 65438+2月，水利電力部將我院確定為水利電力部大壩安全監測中心，承擔水利大壩安全監測工作。1987 10、中國水利學會同意成立中國水利學會科技咨詢服務中心巖土工程服務部。
1988年5月，經江蘇省科委批準，江蘇南水土木工程聯合公司成立。
1989年8月，經水利部基本建設工程質量監督站批準，南京水利科學研究院被確定為水利部基本建設工程質量檢測中心。
1991 10月，接到水利部辦公廳通知，持單位介紹信到辦公廳秘書處領取水利部、交通部、能源部南京水利科學研究院印章。
1992年7月，經水利部黨組批準，撤銷該院黨組，成立臨時黨委。
1993年6月，經江蘇省委組織部批準，該院黨委正式成立。同年9月，江蘇省委批準撤銷南京水利科學研究院中央委員會。
1994年9月更名為水利部、交通部、電力工業部南京水利科學研究院。
1995經水利部批準，與河海大學、水利部南京水文水資源研究所合作成立了水利部遙感技術應用中心南京分中心。
1996年5月，經水利部批準，水利部南京計量檢定中心隸屬於南京水利科學研究院。
1997 3月，經水利部人事勞動教育司批準，“南京水利科學培訓中心”成立。
1998經水利部批準成立南京水利科學研究技術產業中心。
1999年7月，交通部認定南京水利科學研究港口與航道泥沙工程實驗室為交通部重點實驗室。
2001年6月，水利部南京水文水資源研究所並入南京水利科學研究院。水利部南京水文水資源研究所可繼續對外使用。
200110科技部、財政部、中央批準水利部等四部門所屬98家科研機構分類改革總體方案，南京水利科學研究院成為非營利性科研機構，計劃編制393人。
5438年6月+2002年10月，水利部決定將水利部農村電氣化研究所劃歸南京水利科學研究院管理。
2002年6月5日至10月，水利部批復了南京水利科學研究院體制改革總體方案。
2003年4月，水利部教科文司批復，同意在科技部、財政部、中央機構編制委員會接受我院非營利性科研機構改革之前，繼續使用“水利部、交通部、電力工業部南京水利科學研究院”的原名。
2004年6月，水利部認定水利部水科學與水利工程科學重點實驗室為依托南京水利科學研究院。
2005年3月，科技部批準南京水利科學研究院與河海大學共建“水文、水資源與水利工程科學國家重點實驗室”。
2006年4月，水利部批準以南京水利科學研究院為基礎成立水利部水文水資源工程技術研究中心和水利部水利新材料工程技術研究中心。
5438年6月至2006年10月，經水利部人事勞動教育司批準，南京水利科學研究院成立了“退休人員管理處”。