2013年，在ESI評估的22個學科中，學校* * *被ESI收錄3672篇論文，被引用23142次，每次引用頻次6.3，在全球5039家研究機構中排名1664。
2013年，學校“江蘇省重大動物疫病和人畜共患病防控協同創新中心”被評為江蘇省首批高校協同創新中心。揚州大學學報編輯部是在原江蘇農學院、揚州師範學院、揚州科技學院、江蘇商學院等高校學報編輯部的基礎上組建的。1997揚州大學合並五周年之際。《揚州大學學報人文社會科學版》(雙月刊)、《揚州大學學報高教研究版》(季刊)創刊於1997，2004年改為雙月刊；揚州大學學報自然科學版(季刊)創刊於1998；1999將《江蘇農學院學報》更名為《江蘇農業研究》；2002年，《江蘇農業研究》更名為《揚州大學學報農業與生命科學版(季刊)》。
揚州大學學報(人文社會科學版)
本刊是人文社會科學的綜合性學術期刊。雜誌設有中國特色社會主義理論研究、蘇中經濟社會發展研究、中國儒商研究、揚州文化研究、女性文學棱鏡、審美新視角等專欄。本刊是國家中文核心期刊、中國學術核心期刊、中國人文社會科學核心期刊、中國人文社會科學核心期刊、中國期刊方陣、雙效期刊、全國社科百強期刊、華東地區優秀期刊。
揚州大學學報(高等教育研究版)
本刊是壹份綜合性高等教育研究期刊，堅持理論聯系實際，研究和探討高等教育改革與發展的各種問題。它不僅發表高等教育改革與發展的理論研究論文，還發表具有普遍指導意義的高等教育教學改革實踐經驗，涵蓋高等教育的方方面面。本刊被《高校文科學術文摘》、《中國人大復印資料中心》、《教育文摘周刊》、《新華文摘》等不同程度轉載和引用。本刊是中國核心學術期刊，江蘇省優秀期刊，第二屆全國優秀社科期刊。
揚州大學學報(自然科學版)
本刊是自然科學的綜合性學術期刊。主要發表數學科學和化學、工業技術和環境科學方面的學術論文。本刊為國家中文核心期刊、中國期刊廣場雙效期刊、中國科技核心期刊。本刊已被美國數學評論(MR)、俄羅斯文摘雜誌(р)、德國數學文摘(ZBL)、美國化學文摘(CA)、美國生物文摘、中國數學文摘、中國物理文摘、中國無機分析化學文摘和中國生物文摘出版。已被中國學術期刊綜合評價數據庫全文、中國期刊網全文數據庫、中國科學論文統計源期刊、全國報刊索引(自然科技版)、萬方數據庫、中國學術期刊(光盤版)、華誼數字藝術有限公司、中國科學期刊全文數據庫(重慶微普)收錄。
揚州大學學報(農業與生命科學版)(原江蘇農學院學報、江蘇農業研究)
該雜誌是農業和生命科學的綜合性學術期刊。主要發表農業科學、動物科學、動物醫學、生物技術、園藝、植物保護、食品科學、基礎醫學等學科的學術論文。本刊分別被科技部中國科技信息研究所、中國科學院、北京大學圖書館評選為“中國科技論文統計源期刊，即中國科技核心期刊”、“中國科學核心期刊”、“全國中文核心期刊”。被FAO AGRIS、英國CABI、zoologic Record(ZR)、American DIALOG、Chemical Abstracts (CA)、Polish Copernicus Index (IC)、國內所有以“中國”名義出版的農業文摘期刊、部分醫學文摘期刊、中國生物文摘等收錄為文獻源期刊。自2002年以來，多次獲得教育部“全國高校優秀科技期刊壹等獎”和全國優秀農業期刊(學術類壹等獎)，榮獲“江蘇省雙十佳期刊”稱號。截止2014年9月，全校藏書402萬余冊。2001年訂購了3376種中文報刊和548種外文原版期刊。館內有許多大型文獻，如《四庫全書》、《續四庫全書》、《四庫全書目錄叢書》、《中國近現代史料叢書》等。館藏蘇北方誌比較完整，文史農事烹飪類文獻有特色，敦煌學資料豐富。圖書館電子文獻資源豐富，收錄各類電子出版物，包括中國期刊網鏡像站、超星數字圖書館、北大方正Apabi數字圖書系統、EI、PQDD、IEEE/IEE等40種國內外大型數據庫。，相當於6.7萬份電子文檔。