扣稅方法如下：
單位和個人分別在不超過職工本人上壹年度月平均工資12%的幅度內，其實際繳存的住房公積金，允許在個人應納稅所得額中扣除。單位和職工個人繳存的住房公積金，允許在個人應納稅所得額中扣除。
單位和職工個人繳存住房公積金的月平均工資不得超過職工工作地所在設區城市上壹年度職工月平均工資的3倍，具體標準按照各地有關規定執行；
而單位和個人超過上述規定比例和標準繳付的住房公積金，應將超過部分並入個人當期的工資、薪金收入，計征個人所得稅。?通知明確，個人實際領(支)取原提存的“四金”免征個人所得稅。
企事業單位按照國家或省(自治區、直轄市)人民政府規定的繳費比例或辦法，實際繳付的基本養老保險費、基本醫療保險費和失業保險費，免征個人所得稅；
個人按照國家或省(自治區、直轄市)人民政府規定的繳費比例或辦法實際繳付的基本養老保險費、基本醫療保險費和失業保險費，允許在個人應納稅所得額中扣除；
而企事業單位和個人超過規定的比例和標準繳付的基本養老保險費、基本醫療保險費和失業保險費，應將超過部分並入個人當期的工資、薪金收入，計征個人所得稅。
擴展資料：
中央財經大學財政與公***管理學院副院長劉桓在接受記者采訪時認為，這就意味著單位和個人繳納的住房公積金比例將由8%—10%調高至12%。至於這12%的比例是繳納的上限還是底限，財政部稅政司相關負責人未進行解讀。
據了解，對“三險壹金”免征個人所得稅將是國家長期執行的壹項稅收優惠政策，加上“三險壹金”的優惠，我國個稅每月費用扣除額度其實已經不止1600元，達到2000元以上。劉桓表示，住房公積金繳存比例提高，意味著每月工資的個稅扣除額度實際上又調高了。
人民網-個稅起征點變相調高：住房公積金繳存比將至12%