菏澤學院的前身是冀魯豫第二師範學校，創建於1949。歷史上先後更名為平原省菏澤師範學校、山東省菏澤第壹師範學校、菏澤師範專科學校。2002年，菏澤師範學院、菏澤教育學院、菏澤廣播電視大學合並，同時並入菏澤師範學校、菏澤農業學校，建設菏澤學院。2004年，教育部正式批準菏澤學院更名。
教員:
截至2019年4月，菏澤學院有教職工1537人，專任教師1052人，具有碩士、博士學位的專任教師765人，具有高級職稱的專任教師392人。
教師中有全國優秀科技工作者1人，享受國務院政府特殊津貼專家1人，教育部高校生物教學指導委員會委員1人，山東省有突出貢獻中青年專家3人，高校重點學科首席專家2人，本科教育教學指導委員會委員1人，山東省高校名師10人，優秀教學3人37“海上情報專家”。
菏澤學院王牌專業介紹:
省級壹流本科專業建設點(7個):體育學、生物科學、機械電子工程、化學工程與工藝、生物工程、財務管理、音樂學。
山東省高層次應用型專業群:機械電子工程專業群、初等教育專業群、化學工程專業群、生物工程專業群等。
山東省內專業:生物教育、心理咨詢、物理學、財務管理、化學工程與工藝、生物科學。
山東省傑出工程師計劃:機械與電子工程、食品科學與工程。
山東省專業綜合改革試點:財務管理。
山東省重點學科:應用化學和理論物理。
菏澤學院藝術類專業需求水平不斷提升。
藝術、音樂、表演等傳統專業逐漸暴露出就業面窄等問題。
傳統藝術與計算機技術、工業、建築、管理等學科不斷交叉，產生了許多新的專業，這些專業也相應地成為近年來的熱門話題。目前廣告設計、工業設計、建築設計、環境藝術設計、公關策劃、動漫制作、遊戲策劃、遊戲設計等專業人才短缺。
藝術專業正朝著多學科融合的方向發展，實用藝術的應用範圍越來越廣。不懂物理和建築，就不能從事建築和裝修設計；不懂電腦就做不出數字視聽作品。文化課嚴重缺乏的“跛腳”畢業生就業壓力必然很大。
掌握菏澤學院文理專業技能助力就業；
文科畢業生(如文史哲專業)找工作難。由於社會對這類人才的需求有限，且這類學科缺乏專業技能，替代性大，限制了這些專業學生的就業。同樣的問題也出現在以基礎研究為主的純理科畢業生身上。
菏澤學院藝術類專業需求水平不斷提升；
藝術、音樂、表演等傳統專業逐漸暴露出就業面窄等問題。
傳統藝術與計算機技術、工業、建築、管理等學科不斷交叉，產生了許多新的專業，這些專業也相應地成為近年來的熱門話題。目前廣告設計、工業設計、建築設計、環境藝術設計、公關策劃、動漫制作、遊戲策劃、遊戲設計等專業人才短缺。
藝術專業正朝著多學科融合的方向發展，實用藝術的應用範圍越來越廣。不懂物理和建築，就不能從事建築和裝修設計；不懂電腦就做不出數字視聽作品。文化課嚴重缺乏的“跛腳”畢業生就業壓力必然很大。