1.科研教育管理辦公室
管理和協調全院的科研教育工作，制定科研教育計劃；組織申報科研項目；組織院內工作人員的專業培訓；負責與相關社團的聯絡；組織學術交流；負責科研教育項目的開發和管理；負責社會語言文字應用方面的評估和咨詢服務，管理語用學研究所的科研及其他相關檔案。
2.普通話和語言教學實驗室
普通話及其規範研究；推廣普通話方略研究:普通話培訓和測試的理論與方法研究：語言教學的理論和實踐研究；第壹語言教學研究；第二語言教學研究；基於計算機的多媒體語言教學與遠程語言教學研究：識字研究；語言康復研究。
3.漢字與漢語拼音實驗室(詞典研究中心)
文字和漢字的基礎理論研究；漢字規範和標準的發展；社會角色調查研究。漢語拼音及其應用研究:中國盲文和手語的現狀與發展研究。詞典編纂的理論研究與實踐。
4.社會語言學和媒體語言實驗室(廣播電視語言研究中心)
社會語言學的基礎理論研究；語言變異研究；語言與文化的關系研究；語言政策和語言規劃研究；社會語言學與相關學科的關系研究：中國語言文字使用情況調查結果的分析與研究:術語與領域語言研究。廣播影視語言研究；播音員和主持人的語言研究；網絡語言研究；書報語言研究；廣告語言研究；新詞研究。
5.計算機語言學實驗室
語言信息處理的理論研究和應用項目開發；語用學研究所其他研究工作的計算機支持。負責中國語言信息網和語用學研究所局域網的建設、日常管理和維護；組織網站的信息化建設。
6.《語言應用》編輯部(應用語言學研究中心)
研究應用語言學的理論和方法；負責語言文字應用和中文信息的編輯、出版和分發；組織與應用語言學研究中心和雜誌相關的學術活動。
7.普通話培訓辦公室
負責普通話和漢語應用培訓測試中心國內外各類培訓計劃的制定和實施；為本地普通話培訓提供專業指導；組織普通話教學方法和手段的科學研究；組織編寫和修訂相關的普通話教材；負責中心的教務、考試、教學管理和教學檔案管理；參與中心的培訓和測試業務。
8.普通話測試辦公室
負責普通話和漢語應用培訓測試中心國內外測試工作計劃的制定和實施；對地方檢測工作進行質量監督和業務指導；負責測試人員隊伍的建設；組織普通話水平測試理論和方法的科學研究；研究並組織建立國家試題庫，負責中央考試業務檔案管理；參與中心的培訓和測試業務。