1，按件數，如果托運的貨物比較少，體積和重量都比較小，那麽物流公司可能會按件數收費。也就是說按照壹件貨物的運費來計算。而對於那些比較貴的物品，這種方法有時也會用到。
2.按體積或重量收費。壹、根據托運貨物的總體積和總重量的比例，將貨物分為純重貨、重貨和重泡貨。如果是泡沫貨物(比值大於6的貨物)，運費按體積計算；如果是重貨(比值小於3的貨物)，運費按重量計算。
3、綜合重量和體積計費，按照上面的比例，如果比例在3到6之間，屬於重泡沫貨物，那麽物流公司的計費方式就是綜合重量和體積計算物流成本。
4.按協議計費，這是指按照托運人和承運人事先約定的相關價格計算運費，如不規則貨物、需要特殊處理的貨物、搬家貨物、設備貨物、異性貨物等。
5.整車和專用車收費。整車和專用車的物流費用根據物流距離和貨物重量按車輛大小收取。車輛運輸分為返程車和直達車運輸，運輸會隨著季節、油價、市場的變化而波動，具體運費需要咨詢客服。
註意事項:
1.根據運輸方式的不同，物流公司的收費方式可分為鐵路運價、水路運價、汽車運價、航空運價和管道運價；根據運輸距離的遠近，可分為長途運價和短途運價。所以具體的計費方式還是要看具體的商品和線路。
2.物流公司分兩種，壹種是順豐、德邦這樣的物流公司，壹種是特殊的物流公司，比如只在廣東深圳-廣西南寧周邊收貨的物流公司。如果貨物發往廣西南寧，選擇這樣的專門物流公司比較劃算。
百度百科-物流