1、現有社會保障制度存在不完善之處。
首先，現行的養老、失業、醫療、工傷等社會保險制度還存在不完善地方，如現行社會保險政策更多是註重收入管理，漠視支出管理，盡管重點抓了擴大覆蓋面和提高收繳率的工作，但支出管理未及時跟上，社保基金供不應求，矛盾仍然十分尖銳。養老保險的繳費率過高，法定繳費的年限15年大大低於國際上通行的30年、個人賬戶與社會統籌的分配比例經常變化、支付水平與繳費年限和繳費多少缺乏內在聯系、各地區繳費比例不壹等問題。失業保險基金與企業下崗職工最低生活保障金、城市最低生活保障金交叉，資金短缺和交付不到位並存，支付條件過松，滋生惰性機制等。醫療保險基金存在個人賬戶與社會統籌分割比例需合理劃分及兩者消費程序與額度的確定。工傷保險基金存在享受工傷保險條件的確定，由誰管理和運作等問題。總之，現有的社會保險制度存在著待完善之處。
其次，行政事業單位的社會保險制度尚未列上議事日程，農村社會保障制度遲遲不能啟動。我國社會保險制度的改革已近20年，已覆蓋國有企業、集體企業、三資企業和個體工商戶，但是行政事業單位未納入社會保險覆蓋的範圍。顯然與社會制度的社會性與統壹性不相符。
2、政府在社會保障中角色定位。壹些高福利國家的教訓告訴我們，社會保障全部由政府承擔，將不堪重負。我國社會保障制度改革近20年，從其發展過程來看，仍在重復高福利國家的老路，基本養老保險繳費率不斷地提高，還要承擔社會優撫、社會救濟、城市最低生活保障和扶貧等任務。因此既不能誇大政府在社會保障中的作用，也不能忽視市場、企業、個人的作用，由此我國加大了對企業年金的發展步伐。
3、改革目標未達到既定目標。壹是原社會保障由企業和政府包攬的現狀變成目前由政府壹家攬的大鍋飯，政府不僅要辦社會保障事業，而且還要承擔社會保險的補償責任，可能變為中央壹級政府承擔的局面，理由是目前各項社會保險繳費率高達40．6％。盡管如此，有的地方還在提高有關的繳費率，其結果是壹方面企業和個人的繳費負擔加重，部分微利企業將難以負擔；同時對低收入者而言，低收入階層和貧困階層將難以承受。另壹方面，高繳費總是與高替代率相伴而生，既加大社會保險的隱性債務，又加重政策的補貼包袱，陷入壹些高福利國家經歷。二是中央與地方政府的社會保障事權缺乏明確分工，權責脫節現象十分嚴重，社會保險基本處於地方(縣、市、省)政府的分散管理之中，只要基金管理的責任、權利、義務與風險約束壹致起來，分散管理並無不可，分散的管理因為缺乏責、權、利的對等，因此社會保險的風險性與安全性受到嚴重威脅。中央雖然對養老、失業、醫療保險收支有統壹規定，但各地方可按實際狀況自行制定繳費水平與支付水平，加重了企業和職工的繳費負擔，又損害了社會保險對象的既得利益。目前中央政府管補貼，地方政府管錢的局面是權責脫離的社保基金管理體制。
4、管理社會化滯後。社會保障基金的社會化涉及收、支、管、監、服務多方面的內容，建立健全社會保障基金管理社會化機制面臨十分艱巨的任務。壹是社會保險基金征管社會化遲遲不能步入正軌。繳費機制的靈活性，造成繳費約束的軟化和欠繳、拖繳現象，無法實現以稅法為後盾的強制性。社會保險結余資金投資運營渠道單壹，保值增值目標難以實現。社保資金監管體系的建設滯後，導致基金的流失和不安全性在增大。二是社會保險基金納入收支兩條線和專戶存儲的預算外資金管理，沒有納入政府統壹的預算管理。三是監管體系的建設滯後，不利於確保資金的安全和流失增大。
我國社會保障基金管理面臨的問題
社會保障基金作為社會保險的源頭，其管理好壞直接影響到社會保障制度的正常運行，當前我國社會保障基金管理面臨壹些問題。
1、社會保險基金的保值增值面臨困難
社會保險基金特別是養老保險基金的積累部分需要保值增值，是應對未來支付日益增長的支付需要的客觀要求。而目前按照勞動保障養老保險基金的投資運營要求，只能購買國債和銀行存款來實現增值和保值的目的。客觀上社保資金的投資渠道不暢，資本市場發展不順利，造成缺乏相應的選擇性。
2、隱性債務較嚴重
據世界銀行預算，我國城鎮國有企業職工養老保險的隱性債務將達到3萬億元，主要是由於轉制中"老人"與"中人"的轉制成本所造成，兩種人產生了養老金收支缺口，直接構成了養老金的隱性債務。
3、社會保障基金收不抵支
由於近年來工資水平的不斷提高，導致養老金積累難以滿足高工資水平下的養老金支付，加劇了養老保險支付危機的到來。同時，基金的監管、分散管理、缺乏安全的投資渠道等方面的因素，社會保險基金出現了挪用、呆賬、冒領等現象，加劇了收不抵支的矛盾。