該院面對微電子技術、計算機數值模擬方法、精密測量技術、智能機器人、計算機集成制造等為代表的機電壹體化技術的迅猛發展，該院在隊伍建設、科研方向、人才培養模式與培養方向等方面進行了壹系列改革，形成了“工程機械集成制造技術及動態仿真”、“機電系統控制及其自動化”、“精密機械檢測及機電設備性能分析”、“現代機械設計理論與方法”、“機械設備性能分析與試驗”、“工業機器人”等特色鮮明的學術研究方向和科研梯隊，重點建設了機械精密測量實驗室、先進制造技術實驗室、機械原理零件綜合實驗室、工程機械用發動機綜合性能實驗室、塔式起重機整機性能實驗室、機電控制實驗室、單片機、雕塑陶藝實驗室、模型制作等實驗室；並擁有三座標測量機（美國）、電子光學紋影儀（日本）等壹大批高、精、尖設備，等，保證了高水平的本科教學質量，為開展高水平科學研究提供了重要保證。
該學院的老師承擔著包括兩項國家自然基金在內的多項縱橫向科研課題，機電工程學院各專業的畢業生在社會上享有很高的聲譽，就業形勢壹直很好，壹次就業率在校內名列前三。在機械電子工程學科的大平臺下，以工程建設機械的機電壹體化研究為龍頭，加強學科間的相互滲透和協作，開展了卓有成效的研究工作。學院承擔了2項國家自然科學基金，同時還承擔了國家863科技計劃項目、國家留學回國人員基金、國家重點實驗室開放基金、教育部博士後基金、山東省中青年科學家科研獎勵基金、山東省自然科學基金、山東省教育廳科技計劃項目、建設部科技項目等壹大批縱向課題以及由國外投資的數項國際合作項目；與省內外多家企業合作承擔了數十項橫向科研項目，解決了實際生產中的技術難題。2002-2009年，本學科教師***發表核心期刊以上論文300余篇，其中被SCI、EI、ISTP等收錄36篇；出版教材20余部；獲專利10余項；獲得國家科技進步二等獎1項、山東省科技進步二等獎等省部級獎勵多項；多項科研技術成果被企業采用。本學科已培養了數屆碩士研究生，其中不少畢業生考取了國內外重點大學的博士研究生，並依托山東大學招收了3屆博士研究生.