馬加丹州2013年全州地區生產總值為951億盧布，同比增長了2.6%。 馬加丹州的主要工業部門有礦山開采業（采金、銀、錫、煤、鎢）、業、機械制造和金屬加工工業；此外還有水電和火電的制造與傳輸業，主要工業中心為馬加丹、別維克、布拉維捷民亞，阿納德裏。
科雷馬流域是世界上礦產資源最為豐富的地區之壹。采礦業占馬加丹州生產總量的70%。可以說馬加丹州經濟的基礎是采金業，其產值占州預算收入的75%。2010年，馬加丹州的黃金開采量在俄羅斯各地區中排名第6位。該州的黃金開采總量占當年俄羅斯黃金開采總量的9%。除金礦開采外，馬加丹州還開采銀礦和鎢礦。此外，科雷馬地區還富有汞、銅、銻、煤、石油和泥炭。
馬加丹州成立了國家貴重金屬及寶石管理基金會，通過這壹基金會形成州黃金外匯儲備。基金會的基本任務之壹是組織貴重金屬進出口業務，協調稅收，以吸引投資，支持采礦業發展。
馬加丹州最大的（90%）電力制造單位是科雷馬河上的科雷馬水電站。目前正在建設第二個水電站，中坎河河口電站，其投產裝置已於2012年建成。整個水電樞紐預計於2017年完工。電站的發電功率為570兆瓦，平均年發電量25.5億千瓦時。州內還有有阿爾卡戈林斯克發電站和科雷馬克國營發電站。 馬加丹州的農業包括魚類和其他海產品的捕撈業與加工業、家畜養殖業、作物耕種業、養鹿業、養雞業和獸類養殖業。馬加丹州的農業體系對保障居民農產品需求具有極為重要的意義。
漁業是馬加丹州的主要經濟部門之壹，其產品不僅銷往俄羅斯內部市場，還供應出口。占捕撈量比重最大的有明太魚、鯡魚、鮭魚。非魚類漁業品種有蟹、蝦和海螺。行業中的部分捕撈量來自近海水域。漁業是當地居民食品的保障來源。馬加丹州的水產加工基地包括15個沿岸工廠，其技術能力能夠產生300多種不同加工深度的水產品（半保存食品，真空包裝、熏制、腌制、食用和工業用產品）。
馬加丹州主要的出口產品是魚類和其他海產品（占出口總額的70%），其次是黑金屬和有色金屬（17%）。從地域分布上講，出口面向的國家主要是日本（23%）、韓國（16.%）、美國（16%）、英國（10%）。依靠進口比例的增加，馬加丹州對外貿易額穩步增長。基本的商品周轉來自亞太地區的工業發達國家：日本、美國、韓國。而與原經互會國家的貿易關系則漸為削弱。