綜合樓和商品房的區別在於功能。壹是綜合樓為公共建築，有兩個或兩個以上功能層；綜合樓可作為辦公、酒店、娛樂場所、住宅等公共設施。，而商住業主只提供商住功能，不能用於其他方面，這是兩者最大的區別。綜合樓包括商住樓。商住樓使用年限為70年，綜合樓使用年限為50年。商住樓層的安全性相對穩定。但綜合樓搬入搬出時，來網辦事的人員比較復雜，會導致壹定的安全隱患。
商住兩用房的弊端
1.商住兩用房不能遷入戶口。也就是說，即使附近區域有優質的教育資源，孩子也因戶籍問題無法就近上學。
2，50年的土地使用權，是要交土地使用費的，按照國家規定，每年要交0.84%的稅，但是目前還沒有實行，所以很多人不知道這個，所以很多人不知道，如果要提高商品房的銷量，那麽商住樓的稅費也要提高。
3.買賣時的稅費較高。商業地產轉讓要繳納各種稅，還有壹定的個人所得稅(不像住房只有5個人)，所以要繳納3%的稅。所以商務公寓的價格永遠不能和商品房相比。不執行稅收優惠的購房政策。壹般買壹套房子有很多稅收優惠，買兩套房子沒有相關的稅收優惠。
4.物業費、水電費、公共維修基金等費用較高，因為商住樓的水電費是按商業標準執行的，高於普通居住的標準；政府對房地產的收費沒有那麽嚴格；公共維修基金也和商戶享有的物業維修費用壹樣。以上種種因素導致日常生活中商住用房成本居高不下。
5、四五十年產權。普通房屋產權期限為70年，到期後可自動續期，而40年和50年的兩套房屋產權到期後不會自動續期，還要繳納土地出讓金。
6.商住樓的公共* *建築面積普遍較大，入住率略低。但是商品房的優勢也很明顯，不會限購，不會占用房卡，不會影響首付，所以大部分都是小戶型，價格比較高，內部環境也比較好。
7.缺乏完善的生活和輔助服務。商業項目通常不需要提供學校、商業、居委會等配套服務，即沒有幼兒園、學校、醫療、養老等配套服務。這樣會對以後的生活造成很多不便。
8.按揭貸款按商品房標準執行。二套房首付50%，貸款利率1.1倍，貸款期限最長10年。不允許住房公積金貸款。