醫院占地面積52280平方米，建築面積48246平方米。開放床位550張(新建門診樓和呼吸病房樓* * * 2.8萬平方米在建，改擴建後開放床位750張)。醫院技術力量雄厚，專業技術人員占87%；高級職稱100多人，博士、研究生100多人，博士/研究生導師近30人。北京市優秀跨世紀人才、北京市科技新星、有突出貢獻專家、享受政府特殊津貼專家近20人。有結構合理、適應21世紀醫學發展需要的老、中、青相結合的專業人才梯隊。邀請了英美等國內外著名專家組成的客座教授團隊。
醫院非常重視學科建設。從上世紀80年代開始，提出“大專科、小綜合”的思路，成立了肝膽消化科、肝膽外科、肝膽產科、肝膽腫瘤科等科室。中西醫結合治療肝病已成為北京市重點學科。批準成立北京性病/艾滋病臨床診療中心和北京人工肝治療培訓中心；北京肝病內鏡咨詢治療中心；北京肝膽疑難病中西醫結合會診中心。中美肝移植合作中心、佑安醫院肝移植中心、佑安醫院腫瘤介入中心成立。2013針對各種肝病或肝炎，醫院建立了國內外獨壹無二的“內科綜合-人工肝支持-肝移植”壹體化治療模式，擁有自主研發、療效獨特的中藥系列醫院制劑，惠及廣大肝病患者。
佑安醫院建立了關愛艾滋病患者和感染者的NGO組織——“愛心家園”和“肝病康樂家園”，關愛肝病患者，體現人性化服務。醫院有完善的肝膽疾病和感染性疾病的實驗室檢測和輔助治療手段，建立了艾滋病、SARS、中西醫結合等重點實驗室。醫院感染管理等十余項新技術、新業務成為國家級繼續教育項目。
在各項工作中，積極倡導“以人為本”的管理理念，堅持走科教興院之路。大力開展新技術研究，先後承擔國家863、市科委重大科研項目；與意大利、美國和英國的技術合作和研究。承擔了多項國家級傳染病繼續醫學教育項目；出版全國醫務工作者傳染病規範化培訓專著、教材數十部，在核心期刊發表學術論文千余篇。數十名專家在省部級學術期刊上擔任學術職務。
醫院先後被評為“全國衛生系統先進單位”和“北京市精神文明示範單位”。在2003年抗擊非典的戰鬥中，他臨危不懼，救死扶傷，充分展現了當代醫務工作者的風采，榮獲“全國五壹勞動獎狀”、“全國三八紅旗集體”等榮譽稱號。