科研人員中，研究員30人，副高級51，中初級156，其中入選百人計劃8人，國家傑出青年基金獲得者2人，國家“百千萬”壹、二級人選2人，湖南省科技領軍人才、跨世紀學科帶頭人6人，其中63%的人擁有博士學位和碩士學位。
流動人員中，訪問研究員、高級訪問學者20人，博士後項目聘用128人。
中國工程院院士(1):印度於龍(全日制)。
國家傑出青年基金獲得者(2名):中國科學院“百人計劃”研究員夏新界、吳金水入選年度研究方向。單胃動物(豬)的營養研究2014李德軍，區域生態學與景觀生態學2013許，區域生態學與景觀生態學2012陳，作物分子生態學與微生物逆境2009李勇。2009土壤生態學與農業環境魏文2006土壤微生物分子生態學2004作物抗逆性分子生物學印宇龍1999動物生態營養與環境吳金水1998土壤生態學與農業環境研究所官網據2016 1。顯示研究院下設區域農業生態、畜禽健康育種、作物抗逆分子生態學三個研究中心，擁有1中科院重點實驗室、1省級重點實驗室、2個省級工程中心、4個野外站。
中國科學院重點實驗室:亞熱帶農業生態過程重點實驗室
省重點實驗室:湖南省農業生態工程重點實驗室
省級工程中心:湖南省畜禽健康養殖與環境治理工程中心、廣西石漠化治理工程技術研究中心。
各級研究站:桃源農業生態系統觀測研究站、環江喀斯特生態系統觀測研究站、洞庭湖濕地生態系統觀測研究站、長沙農業環境觀測研究站。據2016年6月研究院官網顯示，研究院先後承擔了國家973及支撐計劃(項目主持)、國家傑出青年基金和國家自然科學基金重點項目、百人計劃、中科院重大知識創新工程和重要方向項目等重要科研任務。***173，獲國家、省部級獎勵85項，出版學術專著51部，發表學術論文639篇，申請專利77項。
該院進入知識創新試點後，科技產出數量快速增長。其中“廣西喀斯特地區生態環境建設與農村經濟發展模式”成果入選中國科學院知識創新工程科技進步90項成果；4項成果獲省部級以上科技進步獎，其中“亞熱帶丘陵地區農業有機資源利用及土壤養分調控研究”最近獲2005年湖南省科技進步壹等獎。培育並通過了3個適合中國南方的玉米新品種，申請並授權了15項發明專利。該所與長沙縣人民政府、翔鳳茶廠簽訂合作協議，共建“農業環境與農產品安全實驗站”。實驗基地茶廠各項指標均達到出口歐盟標準，新建成的600畝有機茶園通過有機認證，成為湖南省農業龍頭企業。
國家科技進步獎項目名稱獲獎名稱獲獎年份仔豬腸道健康調控關鍵技術及其在飼料產業化中的應用國家科技進步獎二等獎2010畜禽氮磷代謝調控關鍵技術及安全飼料配制研究與應用國家科技進步獎二等獎2008豬飼料回腸消化率及有效氨基酸需要量國家科技進步獎三等獎1995“農業現代化研究”
《農業現代化研究》創刊於1980年7月。由中國科學院、中國科學院亞熱帶農業生態研究所主辦，科學出版社出版的農業科技綜合性學術期刊。1986 11 10月加入國際連續出版物數據系統(ISDS)，被國家中文核心期刊收錄，先後編入中國學術期刊(光盤版)、中國期刊網、萬芳數據系統、中國科學引文數據庫核心數據庫、中國科技期刊數據庫。
1990獲中國科學院優秀科技期刊獎，1996獲中國科學院優秀科技期刊三等獎；2000年獲中國學術期刊(光盤版)檢索與評價數據規範執行優秀獎；1987、1990分別獲得湖南省優秀科技期刊二等獎，1997-2004連續四次被評為湖南省壹級期刊。2012獲“第二屆湖南省優秀出版獎”。在第三屆中國學術期刊評估中，被評為“RCCSE中國核心學術期刊(A)”。