壹是高校之間的合作:分析支撐壹個行業的主要學科，選擇這些學科中實力最強的高校(學院)聘任領軍人才，建立若幹專業化的先進技術研究實體，確保支撐壹個行業的是學科最強的高校組合，形成最強的研究力量；
二、高校與行業的協作:選擇壹批覆蓋行業全產業鏈的企業和代表性用戶，* * *建立協同創新基金，* * *轉化規劃、評估、投資項目和實施成果，* * *與上遊高校和先進技術研究群體形成“目標壹致、責任壹致、利益壹致”的四個層次。
三、企業與行業的合作:壹項技術的價值最大化，除了自身因素外，與行業整體技術水平高度相關。研究院將圍繞行業整體技術進步，系統開展該領域關鍵技術、關鍵技術、前瞻性技術的研發和轉化，項目完成後，將最適合的企業或新企業設立在中心實施產業化；
四是創新與人才培養的合作:研究院采用“雙課堂、雙導師、雙身份、雙考核”的模式培養高端創新創業人才，即研究生在大學完成理論課程後到研究院承擔實踐性科研任務，大學導師指導學術，研究生導師培養其解決實際問題的能力。研究院給專職人員發工資，提高學生創新積極性，根據理論和實踐成果的高低決定是否授予學位；
第五，首都知識經濟與地方產業經濟的協同:服務首都轉型發展，發揮首都科教優勢，創造先進技術，以知識產權配合地方產業發展，打造知識經濟新模式。