自治縣人民政府設立巍山歷史文化名城保護管理委員會，負責指導、監督、協調名城保護管理工作，管理使用名城保護管理基金。
城建、文化部門是自治縣人民政府負責名城保護管理工作的主管部門，其他有關部門協同做好名城的保護管理工作，各鄉（鎮）人民政府負責本轄區內的有關名城保護管理。第四條 自治縣人民政府設立名城保護管理基金，主要用於名城的保護管理和開發建設。基金來源：
（壹）財政撥款，自治縣上年度本級財政收入的0．5％：
（二）風景名勝區資源有償使用費；
（三）社會捐贈款；
（四）其他收入。第五條 名城保護範圍：
（壹）縣城2．8平方公裏古城區內的古建築、民居風貌、街道格局；
（二）縣級以上人民政府公布的文物保護單位；
（三）巍寶山風景名勝壹級保護區6平方公裏範圍圓覺寺、玄龍寺周圍2平方公裏，龍於圖城遺址。第六條 巍山古城劃分為壹、二、三級保護區。
壹級保護區：拱辰樓（含四方街）至星拱樓街道邊沿外側各30米；
二級保護區：東街、南街、西街、學旁街、大水溝街、雷祖殿街、關聖街、後所街、日升街、月華街；
三級保護區：除壹、二級保護區以外的其他街區。第七條 壹級保護區內的建築物、構築物，其建築形式、體量、色調，必須保持明清時期城池的格局和風貌。凡不符合的必須改造或拆除重建。
二級保護區內新建、改建和擴建的項目，其建築形式、體量、色調和建築風格要與古城風貌相協調。
保護區內的建設項目，應當符合《縣城總體規劃》、《名城保護規劃》，按程序進行審批。第八條 古城壹條街（群力門至南門）、東新街和西新街等主要街道實行店內經營，禁止店外擺攤設點、堆放物品。第九條 自治縣人民政府對文物保護單位和傳統民居劃定保護範圍和建設控制地帶，設置標誌，建立檔案。
在文物保護範圍和建設控制地帶內新建和改建的項目，其設計方案應征得文化行政主管部門同意，並報建設行政主管部門批準。
禁止塗抹、刻劃、損毀或擅自移動保護範圍內的文物、設施和標誌。確需移動的，必須經文化行政主管部門批準。第十條 禁止占用文物保護單位。已經占用的，由自治縣人民政府規定限期遷出。確因工作需要使用文物保護單位的，必須經自治縣人民政府批準，與文化主管部門簽訂使用合同，承擔對文物的保護和維修責任，接受其指導和監督。第十壹條 未公布定級的文物，由文化行政主管部門組織調查、登記、申報定級，並由文物所在地的鄉（鎮）人民政府負責保護管理。
任何單位和個人在自治縣境內發現文物，應當保護好現場，並及時報告文化行政主管部門處理，不得隱匿、私分或轉移文物。第十二條 自治縣人民政府及其文化行政主管部門要對民族典籍、歌舞、音樂、服飾等文化遺產進行搶救、發掘、收集、整理和研究。第十三條 巍寶山風景名勝區各景區、景點由自治縣人民政府設置標誌，建立檔案。
自治縣境內其他景點，由建設行政主管部門組織調查，建立風景名勝資源檔案，並負責申報列級。第十四條 在保護範圍內的風景名勝區禁止亂砍濫伐林木、開山采石、挖沙取土、建造新墳和狩獵放牧；禁止非法侵占土地、水和其他資源。第十五條 自治縣人民政府制定優惠政策，鼓勵國內外組織和個人投資參與名城和風景名勝區的開發與建設。
名城保護範圍內的開發和建設項目，必須按規定辦理審批手續。第十六條 名城保護範圍內的生產、生活、經營及建設活動，必須遵循國家環境保護的有關規定。第十七條 在名城保護管理工作中作出顯著成績的單位和個人，由自治縣人民政府給予表彰和獎勵。第十八條 有下列行為之壹的，由有關部門給予行政處罰。構成犯罪的，依法追究刑事責任。
（壹）在保護範圍內違章建築的，由建設行政主管部門責令停止施工，限期拆除，並處建築總投資額3％至5％的罰款；對直接責任人處300元至3000元的罰款。
（二）在古城壹條街、東新街、西新街等主要街道堆放物品和店外擺攤設點的，由文華鎮人民政府處20元至200元的罰款。
（三）塗抹、刻劃、損毀或擅自移動文物、設施和標誌的，由文化行政主管部門視其情節，處200元以下罰款；情節嚴重的，責令限期恢復，並處受損物價值3至5倍的罰款。
（四）在景區、景點和文物保護範圍內挖沙取土、開山采石和新造墳墓的，由建設行政主管部門責令限期恢復原狀，可並處100元至1000元的罰款。
（五）在保護範圍內的風景名勝區盜伐林木、捕殺野生動物的，由林業行政主管部門分別處林木價值2－3倍的罰款，所獲野生動物價值1－8倍的罰款。