國家核酸成本很高，具體數字無法估算。為了支付核酸檢測費用，地方政府需要承受巨大的壓力。為了提高人民群眾參與核酸檢測的積極性，大部分地方都是免費的，核酸檢測的經費由地方財政承擔。全員搞核酸，不僅需要核酸設備，還需要檢測人員的補貼費用、材料費、檢測費用。這些費用算下來，平攤到每個人身上，大概是六七塊錢。
目前，國家對核酸檢測的收費有明確的規定。單人單管檢測最高收費不能超過16元，混管檢測收費不能超過5元。我們平時參加的核酸檢測都是混管檢測。根據這些數字，我們可以計算出全民核酸的直接成本，也就是平時使用核酸設備的成本。但是這些費用不包括核酸取樣器的工資和核酸檢測設備的費用，所以不可能每個人出5塊錢做真正的核酸檢測。
通用核酸檢測的成本非常大，是壹筆巨大的支出。如果長期堅持做全民核酸檢測，地方財政根本負擔不起。為了應對疫情，很多地方已經開始改變核酸檢測的政策，要求居民自費參加核酸檢測，以減輕當地的財政壓力，保證核酸檢測的順利進行，防止疫情大規模爆發。
有的地方想用醫保基金支付國家核酸檢測費用，但是國家醫保局不支持這種做法，明確不允許動用醫保基金。因為醫保基金像稅收壹樣，有專門的財政賬戶，要專項用於疫情防控的核酸檢測，不符合醫保支出的條件。如果用醫保基金支付大規模核酸檢測，會導致醫保基金嚴重不足。以後再有人生病需要報銷，會遇到很多困難。