1，概念不同
免稅所得，是指屬於企業應納稅所得，但依照稅法規定免征企業所得稅的所得。
不納稅所得額是指在性質和來源上不屬於企業營利活動帶來的經濟利益，不承擔納稅義務，不構成應納稅所得額的收入。如財政撥款、依法收取並納入財政管理的行政事業性收費、政府性基金以及國務院規定的其他非稅收入。
2.不同的法規
根據稅法的壹些規定，免稅收入本身構成應稅收入但被免除的，屬於稅收優惠項目。具體包括以下四項:債務利息收入；符合條件的居民企業之間的股息、紅利和其他股權投資收益；非居民企業在中國境內設立機構、場所，從居民企業取得與該機構、場所實際相關的股息、紅利等股權投資收益；符合條件的非營利組織的非營利收入不包括非營利組織從事營利性活動取得的收入。
3、法律依據不同。
免稅是指不按稅法規定征收銷項稅，進項稅不可抵扣，應轉出。它是鼓勵、支持或照顧某些納稅人或征稅對象的特殊規定，是世界各國和各稅種普遍采用的壹種稅收優惠方式。免稅是壹種將稅收的嚴肅性和必要的靈活性結合起來的措施。