近年來，我校承擔國家重大科技項目、重點研發計劃、重大新藥創制計劃、國家自然科學基金、國家社科基金等1，000余項。近五年獲得國家科技進步二等獎1項，省部級科技獎勵壹等獎5項，省部級科技成果獎36項。
作為總技術支撐單位，承擔了第四次全國中藥資源調查項目，對全省107個縣市進行了中藥資源綜合調查，摸清了中藥資源家底，為我省中藥產業發展提供了決策依據；引導建立了20多個以“秦藥”為特色的中藥材示範種植基地，為促進山區經濟發展、助力鄉村振興發揮了積極作用。
由我校研制，下屬藥廠生產的固腸止瀉丸、咽炎清丸、金沙烏林丸、消炎解熱合劑、天麻眩暈寧合劑、通脈口服液、伊勢口服液等壹系列中成藥暢銷全國，具有較大的經濟效益和社會效益。