(1)辦公室
制定本局和本系統的年度工作計劃和長遠發展規劃；處理局機關日常事務，起草和審核相關文件和報告；負責綜合會議組織、文秘事務、文電處理、文件檔案、文印、信訪、保密、調研、政務信息、稅務宣傳等工作；負責組織稅收科研、學術交流和科研成果的鑒定、評選、推廣和獎勵；制定辦公室規章制度；負責機關的行政事務和後勤保障；負責局機關和系統目標管理的考核和監督工作；組織實施綜合行政管理信息系統；辦理NPC代表和CPPCC委員的建議；協助領導綜合協調相關工作；承辦領導交辦的其他工作。
(2)政策法規科
負責流轉稅、所得稅等稅種的稅務管理業務；管理增值稅專用發票；負責金稅工程流轉稅業務的管理、推廣應用、認證和稅務備案、數據采集和審計管理；負責增值稅等稅種的納稅評估、日常審計和日常管理檢查；負責涉稅法律事務；負責組織稅收法律法規實施的日常管理監督檢查；承辦重大稅收案件的審理、行政處罰和聽證；負責稅務行政訴訟和行政復議；承辦領導交辦的其他工作。
(3)收入會計科
負責稅收籌劃管理、稅務會計、統計等信息數據的統計和分。
工作分析；負責稅收計劃的編制和分配，指導組織收入工作，進行稅收預測分析，負責稅收征管信息的集中處理和核算，組織檢查稅收征管、匯算清繳制度的執行情況；負責稅源數據的調查和計算，監控重點稅源；負責稅務憑證的管理；進行全面的稅務風險分析；負責財務管理；承辦領導交辦的其他工作。
(4)收款管理科
負責組織實施綜合性稅收征管法律、法規和規章，處理稅收征管法律、法規實施中的有關事項；負責稅務登記、納稅申報、稅收征管和稅收信息的管理；牽頭組織對征管質量的全面評估；負責組織征管軟件的推廣應用；牽頭組織、實施、指導、協調和管理納稅評估工作；負責納稅服務的組織和管理；承擔稅收征管的稅收遵從性分析和程序性風險分析；承擔與市內地稅、工商、統計、電力等部門的信息交換；配合外地稅務機關開展發票倒查、異常戶匹配等互動工作；承擔稅收風險的分級管理；負責風險管理相關工作；承辦領導交辦的其他工作。
(5)人事教育組
研究和實施人事管理制度；負責組織、編制、任免、考核、調配、交流、辭職辭退、工資福利、專業技術職務等人事管理工作；負責離退休幹部和提前離崗人員的管理和服務工作；負責思想政治工作、精神文明建設和基層建設；負責教育和培訓的管理；負責機關和系統的外事工作；負責黨建、共青團、婦聯工作；負責機關及直屬單位黨群工作；承辦機關的思想政治工作和精神文明建設；承擔入黨積極分子和黨員發展的教育、培訓和考察工作；承辦領導交辦的其他工作。
加機關黨委辦公室的牌子。
(6)監理辦公室
負責監督檢查黨和國家的路線、方針和稅收法規的執行情況；負責黨的紀律檢查、行政監察和廉政建設；負責執法監督和整改工作；負責信訪舉報，查處違法違紀案件；負責系統作風和效能建設；承辦領導交辦的其他工作。紀檢組和監察室合署辦公，兩塊牌子，壹個班子。
(7)辦稅服務廳
組織、協調、指導本系統各部門、各稅種、各環節的納稅服務工作；組織實施納稅服務工作規範和操作規程；組織實施保護納稅人權益的規章制度和規範性文件；組織協調實施納稅輔導、咨詢服務、稅收法律救濟等工作，受理納稅人投訴；指導稅務糾紛的調解；負責12366熱線、網站納稅服務專欄、短信系統的運營管理。
增設“納稅服務科”牌子(暫時與稅收征收管理科合署辦公，兩塊牌子壹個班子)。
辦稅服務廳暫由第壹稅務分局管理，受理第壹、第九分局的窗口業務。機構是信息中心，級別是正股級。
負責組織稅務管理、綜合行政管理等信息系統建設；實施信息系統管理制度和技術標準；建立、管理和維護計算機網絡和稅務信息的綜合數據庫；參與組織應用軟件開發和稅控儀器的推廣、應用及技術培訓；根據工作需要，對采集和管理的數據進行質量審核、處理和綜合分析；負責網絡和系統安全管理；承辦領導交辦的其他工作。