魅族MX4采用全新Flyme 4.0，基於Android 4.4.4操作系統，整個界面依舊保持了壹貫的“魅族風格”，沒有誇張跳躍的顏色，整個界面和圖標用色都相對克制。為了保持統壹的設計風格，魅族聲稱重繪了1000個第三方應用圖標，100多個通知圖標，500多個常用網站圖標以及700多個輕應用圖標。
按照應用中心的下載排行，隨機挑選了30個應用，正如發布會所述這些第三方應用全部圖標經過了二次加工，所有圖標均為方形+半徑極小的R角，讓界面看起來統壹度更高也更和諧。
對於圖標重繪，錘子、小米已經提前邁出腳步，這對於良莠不齊的Android應用來說是件難能可貴的好事，Android並沒有像iOS壹樣強制應用圖標設計標準，第三方廠商的努力顯得尤為珍貴。預裝系統圖標與此前Flyme 3.0並沒有太大差別，只有圖庫、瀏覽器、時鐘等圖標樣式稍有變化，但依舊與整體保持設計壹致，改變幅度也不算太大。
MX4屏幕增大，隨之Flyme 4.0的圖標也跟著變大，除了底部Dock部分，上面改為容納四行四列圖標排列方式，此前則是五行四列，會明顯感覺屏幕空間更“寬裕”，同時圖標更為“大氣”。
Flyme 4.0的屏幕分頁仍舊采用以往的方式，類似iOS式的壹級式界面，分屏也還是以A、B、C、D等命名方式，固定A頁在主屏左側，其余則是在主屏右側順序排列。
另外，Flyme 4.0還有壹個小功能，在分屏設置界面，除了“添加控件”外，還增設了“圖標對齊”功能，可按照個人喜好從頂部或是底部對齊，對於沒有二級桌面的Flyme來說，這是壹個非常實用的功能，否則妳只能按住圖標壹點點拖拽將其碼放整齊。
相比主界面的變化，下拉菜單算是煥然壹新，放棄了之前依據通知量決定下拉高度的方式，回歸“壹拉到底”的模式，同時樣式與系統契合度更高，整個背景采用不透明樣式，效果非常類似iOS 7，而這樣的設計風格也延續到底部正在運行程序界面部分。幾乎所有界面都開始“不透明”起來的年代，Flyme 4.0的文件夾到是有些出乎意外，展開後的文件夾背景填充色過於飽滿，如果不仔細看很難發現它的不透明設計，更像是壹個純色白色背景平鋪圖。如果能夠改成全屏不透明設計，也許更能夠保持界面的統壹性。
Flyme 4.0終於引入了語音助手，與國內科大訊飛合作，接入了27個內置模塊，並與國內生活服務類應用無縫連接，可直接查詢影院訊息(貓眼電影)、餐廳(大眾點評)、導航(高德地圖)、股票(新浪財經)等。
從目前來看，Flyme 4.0的語音助手可基本實現同類產品的所有功能，包括打電話、發短信、鬧鐘、提醒、音樂、查詢天氣、餐館、翻譯、對話等等。 魅族與生活服務類服務接駁較好，所以語音助手的確可以在生活中起到積極作用，這樣相比壹些動輒就搜索網頁的語音助手實用性要強上許多。 不過，現今語音助手不支持命令修改，若遇到中英文及數字混雜(比如：“魅族MX4”)的語音命令時識別不夠準確，只能壹遍又壹遍的重復嘗試，不可通過打字方式進行更正。
比較有特色的是魅族Flyme 4.0導入了超過15000條售後客服內容，官方寄希望將其打造成智能人工客服。通過試用可以看到對於壹些基礎故障，語音助手還是會給出建議，由於發布會剛結束，部分信息還未更新，比如MX3售價提示為1599元，而MX4的信息則是表示“請關註九月二日的發布會”。
此次魅族終於加入了雙擊亮屏，同時從HOME鍵位置上滑解鎖的功能也得以保留，在此基礎上之上， MX4還加入了四個方向的熄屏操作手勢。