基金公司在理財上比證券公司更專業，基金的收益、風險均比集合理財產品高，流動性、透明度比集合理財產品好很多。
集合理財產品的風險控制得比基金要好，所以風險更低，並且在產品設計上要靈活得多
從歷史的發展來看，集合理財產品只是過渡性的理財產品，會逐漸被基金所排擠
壹般地，資金量大的長線投資者，適合買集合理財產品，普通的投資者，適合買基金。
具體的比較如下：
首先，證券公司集合理財收費機制較基金靈活。基金壹般收取較為固定的管理費，如開放式股票型基金的管理費壹般為1.5％，投資人購買基金還需交納認購費、申購費、贖回費等手續費。現在發行的券商理財產品壹般收取參與費和退出費，比例較證券投資基金的申購贖回費率稍低。至於管理費的提取方式，有的與投資人約定其他收費方式如以市場指數為基準，投資收益超出壹定比例再收取管理費或約定按投資業績計提管理費等，形式比較靈活。
其次，部分券商集合理財產品在設計上采用了“隱性保障”的辦法。壹般的券商集合理財產品都會將壹定比例（不超過5％）的自有資金放入集合資產管理計劃中，並保證在計劃存續期不會退出，有的產品會規定存續期滿如果投資人發生虧損或收益率未達到壹定水平，則管理人將自有資金的本金或收益部分予以有限補償，壹般是自有資金的本金補投資人本金，自有資金收益彌補投資人的收益，直到期自有資金或投資收益全部補償完畢為止。但大多數股票基金不具有這樣的保底功能。而大多數開放式基金（保本基金除外）則沒有這樣的約定，風險由投資者自己承擔。
再次，基金的流動性比證券公司集合理財計劃好。 封閉式基金可以隨時進行買賣；而開放式基金的申購贖回的周期壹般為2～3個工作日，變現容易。證券公司集合理財計劃首先要經歷壹個短則1個月，長則1年的封閉期。即使在開放期，產品的開放日也比較有限，壹般為每個月的3個工作日~5個工作日。
另外，在運作的透明度上，券商集合理財產品不如基金。《證券投資基金信處披露管理辦法》專門對基金的信息披露工作進行規定，要求基金管理人必須每日公布基金的份額凈值，對於基金管理人發生的重大事項也應及時公告，除此之外，還應於每個季度、每半年、每年公布定期公告，詳細說明基金在上述期間的業績表現、投資組合情況、基金管理人的重大事項等內容，使基金持有人能隨時掌握基金最新的運作信息。而關於券商集合理財產品的信息披露，相關法規只要求證券公司至少每三個月向客戶提供壹次準確、完整的資產管理報告，對報告期內客戶資產的配置狀況、價值變動等情況做出詳細說明。由於基金在信息披露方面更規範及嚴格，因此在運作的透明度上要優於券商集合理財產品。
最後，證券公司集合資產管理計劃參與門檻比基金高。券商集合理財參與門檻相對較高，最低壹般為人民幣5萬元至10萬元。投資基金的申購起點壹般都比較低，如開放式基金壹般為1000元，封閉式基金由於在二級市場上交易，沒有限定門檻。