基因組測序在植物領域的應用有：基因組測序、轉基因技術、分子標記輔助育種、單細胞測序技術等。
壹、基因組測序
基因組測序是壹種通過測序技術獲得壹個完整的基因組序列表示的方法。通過得到植物基因組的序列，可以更好地了解植物的基因組結構和功能。基因組測序可以揭示植物間的遺傳差異，解析植物基因、解釋功能以及推斷演化，對植物基因改良具有很大幫助。
例如，通過基因組測序，國內科研團隊成功篩選到世界上最大的冬棗種質資源庫，實現了對冬棗的基因組測序。這項經典的農業基因組學研究讓科研人員深入挖掘到了冬棗基因組信息，並為水果開發提供了技術基礎。
二、轉基因技術
轉基因技術是指將外源基因引入到植物體內來改變其遺傳特點的技術手段。使用基因測序技術可以找到植物中的壹些特殊的基因，從而把它們轉移到其他植物體內，實現育種方法的改良。
例如，在水稻中加入了蘇雲金膜的基因，提高水稻對幹旱、鹽堿、低溫等壓力的適應性，實現了水稻的抗逆能力增強，同時也更加耐熱、產量更高。
三、分子標記輔助育種
分子標記技術是指在DNA水平上尋找基因型特殊的基因。通過分析植物DNA中的不同部分的遺傳變異性，確定與某個表型（如抗病性、耐性、高產性）有關的特定基因位點，以快速獲得所需的新品種。
例如，發現農作物中的簇毛菌根真菌體內有某些基因與耐鹽堿能力有關，而在不含這些基因的農作物中，其耐鹽堿能力較差。利用分子標記技術，可以快速篩選出某些植物品種中可能含有相關基因的植物材料，並進行後續的選擇、育種。
四、單細胞測序技術
單細胞測序技術可以用於檢測單個細胞的基因組序列，避免了傳統生物組學研究中的混雜效應。在植物育種中，單細胞測序技術可以幫助科學家尋找基因表達差異大的質體，並通過進壹步的研究來深入了解這些基因的功能與調節機制。
總之，基因測序技術在植物育種中的應用已經成為了壹個重要的研究方向，因而可以更加準確地預測、培育出有價值的抗病品種和提高產量的品種。不過，也應該在不斷的應用過程中不斷更新改良，提高基因測序技術的水平，進而更好地服務於現代農業和人類的需求和利益。