學院以教學為中心，以本科教育為主體，旨在為培養和造就適應新世紀要求的知識結構合理、理論基礎紮實、實踐能力強、創新意識突出的高素質醫學人才奠定基礎。在當前國內外醫學人才培養形勢下，學院以轉變教學觀念、更新教學理念為先導，以保證和提高教學質量為生命線；以學科和課程建設為主導，以不斷推進基礎醫學課程體系和內部改革為主題；通過引入現代教育技術，改革教學方法，建立相對完善的基礎醫學教學組織管理機制，可以提高基礎醫學的教學水平。近年來，共立項省、校級教學改革項目20余項，獲得省人民政府教學改革壹等獎等多項教學成果獎，發表改革論文200余篇。20多名本科生先後獲得全國大學生挑戰杯金銀獎、全國大學生數學建模競賽壹、二等獎。
兩個學科共有5個碩士點，包括基礎醫學病原生物學、生物醫學工程組織與細胞工程博士點、生物信息學博士點、基礎醫學壹級學科碩士點、生物化學與分子生物學、生理學、細胞生物學與遺傳化學、生物醫學信息技術、組織工程與細胞工程。目前有博士生導師29人，碩士生導師60人，平均每年招收博士、碩士生100余人。學院擁有生物化學和分子藥理學市級重點實驗室；有4個省級重點學科:人體解剖學、法醫學、病理學、生物醫學工程；學校下設基礎醫學研究所、應用解剖學實驗室、腫瘤病理生理學實驗室、免疫學實驗室等7個附屬研究機構。學院以學科建設為主導，圍繞生命科學前沿，積極組織多學科合作攻關，調動科技人員積極性，實現了基礎醫學博士生數量的突破、國家自然科學基金申請和資助數量的歷史性突破，獲得了壹批高水平科研成果和專利。五年來，獲得國家自然科學基金、教育部、衛生部、國家新藥基金項目40余項，年發表論文150余篇，80%被SCI或CSCD收錄，20項通過主管部門成果鑒定。
學院師資力量雄厚，結構合理。教職工227人，其中教授29人，副教授41人，73.91%的教職工擁有博士、碩士學位。有壹批學科帶頭人，全國優秀教師，重慶市優秀教師，重慶市名師，國家教育部首批骨幹教師，重慶市學術技術帶頭人6人。重慶市“322”人才工程庫專家1人，學術技術帶頭人後備人選2人，重慶高校骨幹教師10多人，壹大批中青年學術骨幹正在茁壯成長。該學院非常重視人才培養。近年來，通過加強對外學術交流，先後派出20多名教師赴美國、法國、日本、加拿大、瑞典等國進行學術交流。同時，還邀請了壹批外國專家來校講學和研討，並正在與國外著名大學洽談科研合作和研究生培養事宜。