1997年的合並使得美國金融界兩位最具個性的銀行家帶到了壹起：摩根士丹利的約翰·麥克（John Mack）與迪安·威特的裴熙亮（Philip Purcell），兩人的沖突最終以2001年7月約翰·麥克的離職結束，從此之後裴熙亮就壹直擔任著摩根士丹利主席兼全球首席執行官的職務。在他的帶領下摩根士丹利逐漸發展成為全方位的金融服務公司，提供壹站式的多種金融產品。
在2001年的911事件中，摩根士丹利喪失了在世界貿易中心中120萬平方英尺的辦公空間。公司已經在曼哈頓附近新購置了75萬平方英尺的辦公大樓，目前是摩根士丹利的全球總部。
摩根士丹利總公司下設9個部門，包括：股票研究部、投資銀行部、私人財富管理部、外匯／債券部、商品交易部、固定收益研究部、投資管理部、直接投資部和機構股票部。涉足的金融領域包括股票、債券、外匯、基金、期貨、投資銀行、證券包銷、企業金融咨詢、機構性企業營銷、房地產、私人財富管理、直接投資、機構投資管理等。
摩根士丹利在亞太區有雇員2,000余人，其中有約1,500在大中華區（中國大陸、港澳和臺灣）工作，在香港、北京、上海和臺北設辦事處。1995年8月摩根士丹利與中國建設銀行合資組建中國國際金融有限公司，公司目前控股34.3%。摩根士丹利也因此成為首家在中國內地建立合資投資銀行的國際金融公司。通過在中國的合資銀行，摩根士丹利得以為許多中國公司提供在海外上市的服務，包括中國聯通、中石化和中國電信等，籌得的總資金超過100億美元。
1995年，摩根士丹利成為首家入股中國國內合資投資銀行的跨國銀行。中國國際金融有限公司（簡稱中金公司）為摩根士丹利與中國建銀投資有限責任公司和幾家國內外實體聯合組成的合資公司，摩根士丹利是第二大股東，持有公司34.3%的權益。
中金公司具有豐富的國內和國際資本市場經驗、全面的行業知識、對中國國情的深入理解以及全球支持網絡。中金公司重視發展長期客戶關系，致力於為客戶提供國際水準、高質量的、有獨創精神的金融服務，協助客戶實現其戰略發展目標。總部設於北京並以1.25億美元作為資本金的中金公司，將於2005年9月慶祝其成立10周年紀念。
十年來，中金公司發展迅速，期間曾參與不少重大發行和贏得無數的國際獎項，協助客戶取得成功。中金公司先後於1997年和2000年在香港和上海設立辦事處。中金公司為上海證券交易所、深圳證券交易所及香港交易所的會員。
摩根士丹利和中金公司曾***同參與多個大型國企民營化的上市項目，其中包括：
2005年6月，在中國建設銀行計劃首次公開招股（IPO）之前，引入美國銀行作為策略性投資股東
2004年5月，中國電信股份有限公司後續H股/美國預托證發行，籌得資金17.25億美元
2003年10月，中國人民財產保險股份有限公司IPO並在香港掛牌上市，籌得資金8億美元
2002年11月，中國電信全球IPO並同步在香港和紐約兩地上市，籌得資金15.2億美元
2001年12月，中國鋁業股份有限公司全球IPO並同步在紐約和香港掛牌上市，籌得資金4.86億美元
2000年10月，中石化全球IPO並分別在紐約、倫敦和香港三地掛牌上市，籌得資金34.6億美元
2000年6月中國聯通股份有限公司全球 IPO並同步在紐約和香港兩地上市，籌得資金56.5億美元
身為中金公司的合作夥伴，摩根士丹利深感榮幸，並將繼續致力於建立長期和緊密的夥伴關系，***同促進中國經濟的發展，通過服務我們的國內外客戶，***同繁榮，***享成功。
該企業在2007年度《財富》全球最大五百家公司排名中名列第六十壹。